Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SETP22-201ENST00000412243 957 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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RTL8BQ17RB0 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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RTL8BQ17RB0 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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RTL8BQ17RB0 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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RTL8BQ17RB0 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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RTL8BQ17RB0 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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RTL8BQ17RB0 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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