Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 SF3A3P1-201ENST00000446317 1477 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 ZNF385D-AS2-202ENST00000448980 370 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AKT3-202ENST00000336199 1688 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG5Q9UPR3 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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