Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SGCZQ96LD1 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 ETFBKMT-204ENST00000538391 1067 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SGCZQ96LD1 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms