Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 MIR6834-201ENST00000622807 81 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 OR5AU1-204ENST00000641822 1197 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC006013.1-201ENST00000424888 758 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ZNF32-AS1-201ENST00000453284 434 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 CDKN2AIPNLP1-201ENST00000460287 302 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 CHCHD7-215ENST00000523061 557 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 OR5P3-201ENST00000328375 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 SNORA55-201ENST00000364587 135 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
IFFO1Q0D2I5 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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