Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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CCDC142Q17RM4 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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CCDC142Q17RM4 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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CCDC142Q17RM4 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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CCDC142Q17RM4 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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CCDC142Q17RM4 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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CCDC142Q17RM4 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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