Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PDE4DIP-208ENST00000464103 1055 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC004943.1-203ENST00000624370 1074 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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