Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 CASP4-201ENST00000393150 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC133965.1-201ENST00000452984 354 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 TMEM150C-203ENST00000508701 566 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC023794.4-201ENST00000551732 754 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC243830.3-201ENST00000616810 376 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC073263.3-201ENST00000624449 858 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 OR52A1-201ENST00000328942 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 ZNF343-203ENST00000381253 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 FAM41AY1-201ENST00000421205 906 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 FAM41AY2-201ENST00000458627 906 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 CARSP1-201ENST00000603171 889 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
HLA-DMAP28067 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms