Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LNX1-AS2-202ENST00000509974 628 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC087280.1-201ENST00000530632 1003 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL731556.2-201ENST00000615610 770 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.192-201ENST00000616260 286 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MIR6754-201ENST00000621121 66 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC012100.3-201ENST00000624738 575 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC01173-201ENST00000629370 331 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL158175.1-201ENST00000634327 1127 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC245100.4-203ENST00000635493 1357 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PIK3C3-204ENST00000586545 1554 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 Z96074.1-203ENST00000637685 1746 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AMELY-201ENST00000215479 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 OR5P3-201ENST00000328375 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PHACTR1-204ENST00000379348 795 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CNPY1-202ENST00000406197 560 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL109918.1-202ENST00000406724 436 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL365295.1-204ENST00000425648 553 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CDH13-203ENST00000431540 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CLUHP5-201ENST00000438421 774 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC084809.2-201ENST00000444464 512 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RPL4P2-201ENST00000447259 1282 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.1 ms