Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 ZNF410-205ENST00000442160 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 DPY19L4-201ENST00000414645 6197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 LIMCH1-218ENST00000513024 5129 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 SELENOP-209ENST00000511224 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 FCRL5-201ENST00000361835 5390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PTPRMP28827 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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PTPRMP28827 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
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