Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD12P35452 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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