Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI1P08151 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI1P08151 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AP003066.1-201ENST00000527528 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI1P08151 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI1P08151 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI1P08151 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI1P08151 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
GLI1P08151 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 THSD4-AS1-204ENST00000566268 468 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 OR52A1-201ENST00000328942 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
GLI1P08151 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms