Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 TLN2-211ENST00000636159 7441 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
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TCOF1Q13428 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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TCOF1Q13428 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TCOF1Q13428 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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