Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 KCTD6-201ENST00000355076 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 LCA5-201ENST00000369846 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ERVV-1-201ENST00000602168 2202 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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COL4A5P29400 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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COL4A5P29400 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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COL4A5P29400 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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COL4A5P29400 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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COL4A5P29400 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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COL4A5P29400 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ACSL1-212ENST00000622937 4103 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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