Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 LDHB-201ENST00000350669 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 S100Z-201ENST00000317593 1468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AMELY-202ENST00000383036 621 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC091132.2-201ENST00000433601 769 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 LINC02474-202ENST00000441160 1148 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC034238.2-201ENST00000445660 567 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 B4GALT4-209ENST00000471675 712 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 IGHV3OR16-15-201ENST00000565463 414 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AL034376.2-201ENST00000568110 573 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 RN7SL376P-201ENST00000578594 264 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 RPL35AP25-201ENST00000584631 330 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC012488.1-201ENST00000611221 640 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 ZNF85-202ENST00000328178 2296 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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RAB5AP20339 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 PQLC2L-203ENST00000449199 1484 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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RAB5AP20339 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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RAB5AP20339 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AL031864.2-201ENST00000498507 350 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AL031073.1-201ENST00000503029 1139 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 AC136944.5-201ENST00000573021 151 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB5AP20339 ZNF174-205ENST00000575752 1068 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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