Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx12Q9ER00 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms