Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM3Q9BZL3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms