Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL11Q8NHH1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL11Q8NHH1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTLL11Q8NHH1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms