Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms