Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD4L3Q6VB84 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L3Q6VB84 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms