Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SHEQ5VZ18 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms