Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
MYOM3Q5VTT5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYOM3Q5VTT5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms