Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP350Q5VT06 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms