Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATRQ13535 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATRQ13535 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRQ13535 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRQ13535 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRQ13535 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRQ13535 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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