Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK18Q07002 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms