Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRCA2P51587 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRCA2P51587 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms