Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPN7P35236 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPN7P35236 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms