Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF1RP07333 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms