Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGR5O75473 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGR5O75473 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGR5O75473 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGR5O75473 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGR5O75473 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGR5O75473 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGR5O75473 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGR5O75473 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR5O75473 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR5O75473 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR5O75473 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR5O75473 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR5O75473 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR5O75473 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR5O75473 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR5O75473 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR5O75473 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR5O75473 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR5O75473 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR5O75473 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR5O75473 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LGR5O75473 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LGR5O75473 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms