Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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VEGFDO43915 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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VEGFDO43915 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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VEGFDO43915 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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VEGFDO43915 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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VEGFDO43915 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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VEGFDO43915 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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VEGFDO43915 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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VEGFDO43915 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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VEGFDO43915 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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VEGFDO43915 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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VEGFDO43915 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VEGFDO43915 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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