Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN4O43707 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms