Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA3EO15041 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms