Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps1O08983 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps1O08983 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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