Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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USP18Q9UMW8 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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USP18Q9UMW8 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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USP18Q9UMW8 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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USP18Q9UMW8 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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USP18Q9UMW8 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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USP18Q9UMW8 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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