Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 CST11-201ENST00000377007 461 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 RNVU1-15-201ENST00000384476 165 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 TDGF1P4-201ENST00000401555 520 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 GLS-205ENST00000409626 997 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC012506.4-202ENST00000430051 572 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC138089.1-201ENST00000450847 967 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AP003774.3-201ENST00000457725 985 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL508P-201ENST00000464472 303 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL464P-201ENST00000492743 297 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 NR1I3-226ENST00000508740 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC017007.5-201ENST00000511590 874 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 HMMR-AS1-201ENST00000514724 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC060765.1-202ENST00000518367 257 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 LRP1-AS-201ENST00000554476 325 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC099684.3-201ENST00000574483 560 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC011472.3-201ENST00000586051 906 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC015802.4-201ENST00000589963 578 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL034428.1-202ENST00000613736 625 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 LINC01620-205ENST00000637248 546 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC119674.1-201ENST00000641611 1210 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 CACNB4-263ENST00000637779 1772 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 CDKL5-202ENST00000379996 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 OR52K3P-202ENST00000641797 1729 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL512604.2-201ENST00000426946 1314 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K19-205ENST00000392917 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 DHRS9-202ENST00000412271 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 ELF5-201ENST00000257832 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1P13-201ENST00000503537 1389 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC114324.1-201ENST00000504077 3152 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 FAM107B-202ENST00000378458 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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