Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL035530.2-201ENST00000607391 1675 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 MID1-203ENST00000380780 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 OR8J1-201ENST00000303039 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 UBXN10-201ENST00000375099 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 SECISBP2L-209ENST00000559471 7176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 IL24-207ENST00000611909 1621 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 LRRC4C-202ENST00000527150 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
POLR2AP24928 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms