Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 IL12B-201ENST00000231228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 C12orf77-202ENST00000549262 1443 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 MAML3-201ENST00000398940 831 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 RPL24P8-201ENST00000446071 474 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AL391380.1-201ENST00000439300 1432 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AC020983.1-201ENST00000417063 543 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 VN1R35P-201ENST00000428102 693 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SMG5Q9UPR3 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms