Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms