Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC091563.1-201ENST00000520544 490 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC073529.1-202ENST00000608576 1080 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
POLD1P28340 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 IL24-207ENST00000611909 1621 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
POLD1P28340 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms