Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 C18orf32-203ENST00000613385 5395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL161729.2-201ENST00000605700 456 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TMSB15B-208ENST00000620307 2286 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL355483.4-201ENST00000432653 470 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms