Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 OR51M1-201ENST00000328611 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FAM3AP98173 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms