Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms