Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CASP1P29466 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CASP1P29466 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CASP1P29466 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CASP1P29466 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CASP1P29466 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CASP1P29466 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CASP1P29466 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CASP1P29466 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 OR10D3-201ENST00000318666 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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CASP1P29466 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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CASP1P29466 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CASP1P29466 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CASP1P29466 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CASP1P29466 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CASP1P29466 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CASP1P29466 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CASP1P29466 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CASP1P29466 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
CASP1P29466 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
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CASP1P29466 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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CASP1P29466 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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