Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms