Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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CCDC96Q2M329 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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CCDC96Q2M329 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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CCDC96Q2M329 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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CCDC96Q2M329 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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CCDC96Q2M329 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CCDC96Q2M329 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC96Q2M329 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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