Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC016542.3-201ENST00000623520 619 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC004943.1-203ENST00000624370 1074 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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USP18Q9UMW8 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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USP18Q9UMW8 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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USP18Q9UMW8 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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USP18Q9UMW8 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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USP18Q9UMW8 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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USP18Q9UMW8 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP18Q9UMW8 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
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