Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms