Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC009108.1-201ENST00000473913 796 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 DLX5-202ENST00000486603 1074 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 STMN2-203ENST00000518491 585 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC011379.2-201ENST00000523154 583 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC002428.1-201ENST00000523722 771 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC063923.2-201ENST00000562158 928 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 ARPP19-213ENST00000569723 550 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC091132.5-205ENST00000585761 560 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN30-210ENST00000601405 510 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00837-203ENST00000608061 555 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6732-201ENST00000619365 60 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AL136038.5-201ENST00000620835 554 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 RAB3IP-215ENST00000551641 2840 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 WBP2NL-201ENST00000328823 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 TSC22D1-201ENST00000261489 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 TCL6-207ENST00000483087 2194 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01572-201ENST00000561611 2194 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 JADE1-202ENST00000413543 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 OR2D3-201ENST00000317834 1070 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 GNL2-201ENST00000373062 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 UQCRHP2-201ENST00000415651 288 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC128709.3-201ENST00000420213 626 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AL355863.1-201ENST00000424331 293 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC004006.1-201ENST00000434994 377 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC112493.1-202ENST00000436019 673 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 WBP1LP7-201ENST00000437905 363 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 GNA14-AS1-201ENST00000439145 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 MYB-AS1-201ENST00000455534 449 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 ENPP7P2-201ENST00000462675 943 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL28P-201ENST00000488836 298 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC087241.3-201ENST00000542076 862 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 FOXG1-AS1-201ENST00000546560 538 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CHURC1-202ENST00000548752 439 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 PLA2G1B-203ENST00000549767 562 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AL591767.2-201ENST00000554984 173 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC093249.5-201ENST00000568120 430 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 GLUD1P8-201ENST00000585063 203 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7L1P5-201ENST00000590816 738 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC243960.5-201ENST00000597858 255 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01515-207ENST00000598092 496 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 STX8P1-201ENST00000603161 355 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02018-202ENST00000608707 445 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC024559.2-202ENST00000615240 529 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02028-221ENST00000622169 621 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TIMMDC1Q9NPL8 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms