Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC010976.1-205ENST00000596439 1007 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL121583.1-201ENST00000612444 682 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM71Q2Q1W2 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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