Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FAM3AP98173 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms