Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVS71-1P61550 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms